中醫(yī)膝痹病臨床文獻挖掘研究
時間:2022-03-06 10:54:22
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〔摘要〕信息時代,科學(xué)技術(shù)的發(fā)展突飛猛進。以信息技術(shù)為基礎(chǔ),以中醫(yī)藥膝痹知識為資源,建立中醫(yī)膝痹病數(shù)據(jù)庫,能為中醫(yī)膝痹病教學(xué)、臨床與科研提供知識發(fā)現(xiàn)的基礎(chǔ)設(shè)施,有利于中醫(yī)知識傳播共享與增值利用。探析中醫(yī)骨傷科膝痹病文獻數(shù)字化保存數(shù)據(jù)庫建立的步驟、方法、功能、內(nèi)容、數(shù)據(jù)庫維護,數(shù)字化保存與挖掘中醫(yī)膝痹病臨床文獻,為臨床實現(xiàn)中醫(yī)膝痹病證治的標(biāo)準(zhǔn)化、數(shù)據(jù)化提供行之有效的思路與方法。
〔關(guān)鍵詞〕膝痹??;數(shù)據(jù)庫;文獻;數(shù)據(jù)挖掘
膝痹病又稱膝骨關(guān)節(jié)炎(kneeosteoarthritis,KOA),是一種常見的以膝關(guān)節(jié)軟骨的變性、破壞及骨質(zhì)增生為特征的慢性關(guān)節(jié)病,屬中醫(yī)學(xué)“骨痹”范疇,是臨床較為多見的慢性骨關(guān)節(jié)性疾病,此種疾病不僅患病率較高且病變的范圍較為廣泛,后期嚴重影響肢體功能,甚至致殘。緩解KOA病人疼痛,恢復(fù)患膝功能,改善生活質(zhì)量,一直是骨傷科臨床的重要研究課題。本課題擬建立膝痹病專題數(shù)據(jù)庫,目的是通過對中醫(yī)膝痹病古今文獻進行挖掘、分析,總結(jié)前人對中醫(yī)膝痹病證治思想,發(fā)現(xiàn)診療規(guī)律,系統(tǒng)總結(jié)中醫(yī)膝痹病的理論和辨證論治體系,從而提高膝痹病中醫(yī)診療與服務(wù)水平。其作用突出表現(xiàn)在三個方面:一是為臨床治療疾病提供一定依據(jù),提高醫(yī)療質(zhì)量、提高醫(yī)療效率;二是傳承中醫(yī)治病經(jīng)驗和傳統(tǒng)特色方法;三是便于臨床教學(xué)和科研使用[1-2]。
1數(shù)據(jù)庫建設(shè)
1.1文獻來源。膝痹數(shù)據(jù)庫是為國家臨床重點專科重點病種膝痹病服務(wù)的專題數(shù)據(jù)庫。研究收集較為規(guī)范的膝痹病古今文獻,較為全面地收集中醫(yī)院士、國醫(yī)大師、全國名中醫(yī)、國家級名老中醫(yī)藥專家及近現(xiàn)代具有重要影響力的中醫(yī)骨科專家的膝痹經(jīng)驗。數(shù)據(jù)庫文獻來源主要包括:(1)紙質(zhì)版書籍。以“痹”或者“關(guān)節(jié)炎”為關(guān)鍵詞項檢索詞,在中國國家圖書館•中國國家數(shù)字圖書館檢索發(fā)現(xiàn)膝痹專著,或者包含膝痹論述的專著書目。購買膝痹病古籍、近現(xiàn)代名老中醫(yī)關(guān)于膝痹病的著作。(2)數(shù)字化文獻。整合湖南中醫(yī)藥大學(xué)圖書館的數(shù)字資源,納入中國知網(wǎng)、萬方數(shù)據(jù)資源、中國生物醫(yī)學(xué)文獻數(shù)據(jù)庫、超星期刊、維普中文期刊服務(wù)平臺、PubMed、MedlineComplete等中文、外文文獻數(shù)據(jù)庫。數(shù)據(jù)庫中涵蓋了關(guān)于膝痹病的期刊論文、會議論文、博士論文、碩士論文、報紙、標(biāo)準(zhǔn)、專利、成果等多種學(xué)術(shù)資源。(3)網(wǎng)絡(luò)資源。采集關(guān)于膝痹病的網(wǎng)絡(luò)信息資源,如新藥、科研獎勵、新技術(shù)研發(fā)等。1.2古籍整理。1.2.1書目的分類膝痹病古典專著較少,很多相關(guān)文字記錄都是散見于各類中醫(yī)醫(yī)籍里,然而每本書籍論述的內(nèi)容以及著重點均不相同,所以研究團隊根據(jù)其側(cè)重點將古典書籍進行分類,列為中醫(yī)理論類、中草藥類、方劑類、針灸推拿類、按摩導(dǎo)引類、臨證醫(yī)案類等。1.2.2資料的摘編為了適應(yīng)臨床的實用和后期數(shù)據(jù)庫的開發(fā)及維護等要求,摘編的基本原則設(shè)定如下:(1)內(nèi)容在200字以下的一般應(yīng)采取以文摘卡形式摘錄;(2)內(nèi)容在200字以上的采取掃描全文或者復(fù)印的方式,最后予以剪貼整理;(3)摘編的書名、版本、作者、出版社、疾病名或病證名、篇名、起止頁碼、出版時間、摘抄人、復(fù)核人等重要內(nèi)容必須信息完備。1.2.3資料的分類整理按時間(朝代及年份)的先后順序、作者、成書年代、疾病或病證名、病因病機、治則治法、方藥、調(diào)護等方面分類整理,待所有資料的錄入全部完成后,再經(jīng)二次校稿篩查整理完成。1.2.4中醫(yī)膝痹病敘詞表的建立敘詞,是一類經(jīng)過特殊規(guī)范化處理的詞或者詞組,它具有以基本概念為基礎(chǔ)能夠表達出文獻主題的特性或?qū)傩浴6哂羞@類特性或?qū)傩缘脑~或者詞組的匯集就組成了敘詞表,可以用于檢索和標(biāo)引,它還能體現(xiàn)概念之間的相互關(guān)系。故中醫(yī)古籍?dāng)⒃~表的建立對后續(xù)進行中醫(yī)古籍信息標(biāo)引時主要起到能夠自動(輔助)選擇索引詞的功能,及進行檢索時的后控制,是提高查全率、查準(zhǔn)率、實現(xiàn)多語檢索和智能化概念檢索的重要途徑,是構(gòu)建中醫(yī)古籍知識庫的基礎(chǔ)[3]。借鑒以往構(gòu)建中醫(yī)古籍?dāng)⒃~表的方式方法,研究團隊擬采用以下幾步建立中醫(yī)膝痹病文獻敘詞表:(1)參考GB13190-91漢語主題詞表編制規(guī)則和GJB1776A-99軍用主題詞表編制規(guī)則制定詞表的編制標(biāo)準(zhǔn);(2)大量收集現(xiàn)有的與中醫(yī)藥相關(guān)的主題詞表,包括已頒布的當(dāng)前各種有關(guān)的國標(biāo)、行標(biāo)、參考以及各類中醫(yī)藥相關(guān)工具書。病名證名的制定和選取主要參考各類中醫(yī)辭典、《中醫(yī)病證名大辭典》以及《中醫(yī)名詞術(shù)語精華辭典》或者其他經(jīng)典名籍文獻中收錄[4];(3)在類目層級設(shè)置上,盡量減少層級,對文獻較多,檢索頻率較高的類目適當(dāng)提高其列類等級,增強分類法的易用性和直觀性[5]。1.3現(xiàn)代文獻整理。1.3.1文獻的分類現(xiàn)代膝痹病文獻較多,包含各大數(shù)據(jù)資源,因此,研究團隊可以根據(jù)文獻的種類以及研究的方向來進行分類整理,分為學(xué)術(shù)期刊、會議論文、博碩士學(xué)位論文等。根據(jù)其研究方向的側(cè)重點不同可以分類為:實驗研究、臨床觀察、基礎(chǔ)理論研究等。1.3.2資料的歸類整理按文獻發(fā)表的先后時間順序、期刊雜志類型、臨床治療、實驗研究等歸類整理,待所有資料的錄入全部完成后,再經(jīng)二次校稿篩查整理完成。1.4數(shù)據(jù)庫建設(shè)步驟。1.4.1制定數(shù)據(jù)庫檢索關(guān)鍵詞根據(jù)臨床研究及科研需求,結(jié)合文獻庫的特點,選定檢索關(guān)鍵詞,如病名、辨證分型、治療方法等,設(shè)定規(guī)范的關(guān)鍵詞語用于檢索,檢索關(guān)鍵詞的制定參考中醫(yī)診斷學(xué)、中醫(yī)骨傷科常見疾病診療指南及我院制定的中醫(yī)膝痹病診療規(guī)范,制定膝痹病敘詞表。1.4.2文獻信息采集與加工主要是圖文信息的采圖1數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)建立工作流程圖集,文本類的可以用高掃或者OCR識別,圖像類的信息可以借助于數(shù)碼攝像機或相關(guān)攝像工具;資源可以使用采編軟件、動態(tài)軟件系統(tǒng)或TRS管理員工具等有關(guān)系統(tǒng)軟件進行。利用開發(fā)工具MicrosoftVisualStudio、Dreamweaver、Photo-shop設(shè)計。文獻的整理分為四個方面:(1)按照歷史年代延續(xù)的先后(先秦-兩漢-晉-唐-宋-金-元-明-清),對歷代先賢關(guān)于膝痹病的相關(guān)論述,追其溯源,知其由來,審其變遷;(2)整理目前現(xiàn)有的中醫(yī)和西醫(yī)所有關(guān)于膝痹病的診治資料,含括其基本概念、發(fā)病機制、證候特點以及論治規(guī)律等;(3)按類歸納古今名家對膝痹病臨床治療的經(jīng)驗籍冊,古代名家可按歷史朝代先后分類,現(xiàn)代名家則按國家級和省級名老中醫(yī)分類收錄,研究了解不同時代醫(yī)家們關(guān)于膝痹病的認識及其論治心得;(4)廣泛整理收集中醫(yī)從古至今治療膝痹病的相關(guān)內(nèi)服外敷的專方專藥,或者敷貼、熏洗、針灸等治療方法。1.4.3制定策略校對文獻原始資料,提取與中醫(yī)膝痹病相關(guān)的章節(jié)內(nèi)容,提煉檢索詞語。1.4.4檢索數(shù)據(jù)庫將檢索出來相關(guān)結(jié)果反饋給檢索者進行篩選或者供其調(diào)整檢索方式方法進行再次或多次檢索。經(jīng)檢索后將符合要求的數(shù)據(jù)格式進行規(guī)范化處理后導(dǎo)入數(shù)據(jù)庫。數(shù)據(jù)字段參考CBM的全字段標(biāo)準(zhǔn)。1.4.5文獻分析與挖掘在做到對“專而精”的文獻資料系統(tǒng)規(guī)范化采集基礎(chǔ)上,對文獻資料分析與挖掘,使其能夠?qū)υ假Y料中“理-法-方-藥”之間的關(guān)聯(lián)規(guī)則進行統(tǒng)計分析,為形成系統(tǒng)理論體系提供資料支持。1.4.6數(shù)據(jù)庫軟件創(chuàng)建步驟待研究團隊完成了數(shù)據(jù)庫創(chuàng)建的前期工作,研究團隊最后一步就是如何將研究成果應(yīng)用于臨床實踐,所以數(shù)據(jù)庫的創(chuàng)建其實就是理論到實踐的過程。研究團隊將按以下步驟創(chuàng)建數(shù)據(jù)庫軟件:(1)安裝MySQL數(shù)據(jù)庫軟件,并且配置信息(MySQL是一個關(guān)系型數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng),將數(shù)據(jù)保存在不同的表中,而不是將所有數(shù)據(jù)堆積在一個大的倉庫內(nèi),于是就提高了數(shù)據(jù)庫的運行速度和靈活性);(2)創(chuàng)建連接。創(chuàng)建一個數(shù)據(jù)庫的連接,只有創(chuàng)建了數(shù)據(jù)庫連接,才能在該數(shù)據(jù)庫的方案中創(chuàng)建、更改對象或編輯表中的數(shù)據(jù);(3)測試連接。填寫對應(yīng)的連接名、主機名、端口、用戶名和密碼,確定數(shù)據(jù)庫連接無誤;(4)新建數(shù)據(jù)庫。根據(jù)前面創(chuàng)建的連接,在該連接下新建數(shù)據(jù)庫,填寫數(shù)據(jù)庫的名稱和字符編碼(UTF-8);(5)新建表。在新建的數(shù)據(jù)庫下建立本項目所使用的表,本項目建立的表主要為:搜索答案詳情表(字段包括title,document,category等),搜索關(guān)鍵詞詳情表(字段包括number,searchWord等)以及關(guān)鍵詞與title的映射表(字段包括num-ber,title等);(6)數(shù)據(jù)導(dǎo)入。在新建好的表中導(dǎo)入搜集到的數(shù)據(jù);(7)數(shù)據(jù)驗證。待數(shù)據(jù)導(dǎo)入結(jié)束,測試導(dǎo)入的正確性,通過SQL的相關(guān)查詢語句驗證表內(nèi)數(shù)據(jù)的條數(shù),以及抽樣查看表中數(shù)據(jù)與導(dǎo)入數(shù)據(jù)的一致性(例如:select*frommyTablewhereds='20190222'andsearchWordisnotnull,查詢表中行數(shù):selectcount(*)frommyTablewhereds='20190222')。見圖1。
2數(shù)據(jù)庫內(nèi)容與功能
中醫(yī)膝痹病數(shù)據(jù)庫,包括臨證醫(yī)案記錄288條,臨床經(jīng)驗378條,理論研究265條、針灸推拿126條、按摩導(dǎo)引56條等,數(shù)據(jù)庫具備文獻檢索、信息統(tǒng)計、數(shù)據(jù)挖掘等功能。建成的專題數(shù)據(jù)庫以統(tǒng)一格式存儲中醫(yī)膝痹病各類文獻不同格式的信息,但依照資料類型分為古籍文獻模塊、名老中醫(yī)病例模塊、病案模塊、期刊文獻模塊、學(xué)位論文模塊、會議論文模塊、研究進展模塊。本數(shù)據(jù)庫收集清及以前各醫(yī)家、近現(xiàn)代名老中醫(yī)文獻資料,通過建立中醫(yī)膝痹病古籍?dāng)⒃~表,歸納膝痹病的病名、證候診斷、中醫(yī)治則治法、中藥、方劑、辨證論治規(guī)律,同時對方劑和中藥進行相關(guān)性分析,以了解治療某證候的各味中藥使用頻率,達到運用這一數(shù)據(jù)庫可以查到治療膝痹病的某一方劑,再從方劑查到相關(guān)的中藥材,對膝痹病復(fù)方及單味藥進行深入研究。數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)提供統(tǒng)一的檢索界面,支持多種途徑檢索,如題名、朝代、著者、辨證分型、治療方法等,也支持“=”“(”“)”及邏輯算符“或”“與”“非”等多種檢索方式;可按缺省設(shè)置、全部字段或任選字段等模式自由顯示檢索結(jié)果,若該文獻帶有全文下載,按照要求點擊后即可獲取原文或相關(guān)章節(jié);若該板塊帶有數(shù)據(jù)統(tǒng)計功能,則可按照需求進行相關(guān)數(shù)據(jù)統(tǒng)計[6]。數(shù)據(jù)庫的管理員在登錄時需要先輸入提前設(shè)定好的口令,登錄成功后才能在系統(tǒng)據(jù)庫管理員工作流程圖中進行相關(guān)管理活動,例如對條文信息查閱、修改編輯以及對數(shù)據(jù)庫中現(xiàn)有的條文進行刪除等管理,管理員還具有對條文關(guān)鍵詞的管理權(quán)限。普通的用戶則需要進入到數(shù)據(jù)庫軟件檢索頁面,然后輸入所需要信息的關(guān)鍵詞進行檢索并瀏覽相關(guān)信息。
3數(shù)據(jù)庫維護
據(jù)庫建設(shè)完成后,若在使用中發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)錯誤、文獻特征不準(zhǔn)確或數(shù)據(jù)內(nèi)容不全面時,可以及時修正。同時本數(shù)據(jù)庫注重動態(tài)更新,能夠及時補充和添加心得等相關(guān)內(nèi)容資料,設(shè)定每間隔半年就進行一次數(shù)據(jù)的維護及更新。本數(shù)據(jù)庫的建設(shè)理念不僅在數(shù)據(jù)內(nèi)容上保證了全面性和連續(xù)性,而且在資源整合上充分體現(xiàn)了發(fā)展性和不間斷性,使數(shù)據(jù)庫在質(zhì)量和生命力長久方面得以保證。信息化社會,科技發(fā)展日新月異,新知識、新技術(shù)不斷涌現(xiàn),中醫(yī)藥數(shù)字化信息建設(shè)勢在必行。中醫(yī)膝痹病數(shù)據(jù)庫以信息技術(shù)為基礎(chǔ),以中醫(yī)藥膝痹知識為資源,為開展中醫(yī)膝痹病教學(xué)、科研與診療技術(shù)創(chuàng)新提供知識發(fā)現(xiàn)的基礎(chǔ)設(shè)施。研究團隊力求構(gòu)建一個基本成型的膝痹病專題文獻數(shù)據(jù)庫,實現(xiàn)本領(lǐng)域文獻的規(guī)范化、標(biāo)準(zhǔn)化及統(tǒng)一化管理,以建成高質(zhì)量的特色文獻數(shù)據(jù)庫,通過“中醫(yī)膝痹病臨床文獻”的網(wǎng)絡(luò)傳播,提高對中醫(yī)膝痹病的學(xué)術(shù)研究水平,推進我國中醫(yī)骨傷事業(yè)的發(fā)展。
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作者:程學(xué)榮 李木清 張月娟 劉黎 李成麗 楊振武 姜雄 杜攀攀